構建有潛在高親和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-變形桿菌（USCα）的基因
文章來源：撰稿/供圖：王越 | 發布時間：2020-01-16 | 【打印】 【關閉】
近日，地外海洋系統研究室與普林斯頓大學地球科學系Tullis C. Onstott教授研究團隊合作在國際期刊《Microbiology Resource Announcements》上發表了題為“Metagenome-Assembled Genome of USCα AHI, a Potential High-Affinity Methanotroph from Axel Heiberg Island, Canadian High Arctic”的論文。深海所劉翠艷研究員為通訊作者。
該研究團隊在2011-2013年期間在加拿大北極高地海伯格島（Axel Heiberg Island；AHI）檢測到含低碳的凍土夏季時分是甲烷匯，并在2015-2016年報道了AHI融凍層含活躍的微生物，負責氧化空氣中低甲烷濃度的微生物豐度非常低（~1%）。不過，這些高親和力的甲烷氧化菌未被培養和分離。
本研究從21個融凍層的實驗樣品提取的宏基因組數據，通過拼接手法，構建了有潛在高親和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-變形桿菌（USCα）的基因組，從而揭示其生理和生長需要。
拜葉林克氏菌科甲烷氧化菌與USCα AHI的基因組比較（Rusley et al.,2019）
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