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深海科學與工程研究所
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FISH-TAMB,一種無需固定細胞的mRNA 熒光標記技術

文章來源:供稿/供圖:劉翠艷  |  發布時間:2022-01-18  |  【打印】 【關閉

  近期地外海洋系統研究室劉翠艷研究員作為共同通訊作者在微生物生態學期刊Microbial Ecology上在線發表論文一篇,題為 FISH-TAMB, a Fixation-Free mRNA Fluorescent Labeling Technique to Target Transcriptionally Active Members in Microbial Communities。研究人員開發了一種適用于標記古菌和細菌的信使RNA(mRNA)的熒光原位雜交(FISH)技術。FISH-TAMB 方法與現有 FISH 方法的不同之處在于緩沖液中不含固定劑或表面活性劑,在目標細胞的生長溫度下雜交時間短至 15 分鐘,并且省略了洗滌步驟。論文詳細地介紹了 FISH-TAMB 的制備和應用例子。通過對(1) 表達產甲烷菌 Methanosarcina barkeri mcrA基因的大腸桿菌; (2) M. barkeri;和(3) 來自深部大陸鉆孔的厭氧甲烷營養 (ANME) 富集培養,證明了FISH-TAMB 標記細胞內 mRNA 靶標、區分轉錄狀態、檢測活躍和稀有分類群以及保持細胞活力的能力。FISH-TAMB 具有多復用和可應用于16S rRNA的潛力,在環境微生物學領域具有潛在的廣泛應用。 

 

    

FISH-TAMB探針構象及與信使RNA雜交過程(Harris, Lau et al. 2021) 

    

  原文鏈接: 

  https://link.springer.com/article/10.1007/s00248-021-01809-5 

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